Zum 01.01.1995 wurde der Eigenbetrieb "Abwasserbeseitigung Markdorf" gegründet. Durch die eigenen Wirtschaftsführung wurden die Kosten für die Abwasserbeseitigung aus dem städtischen Haushalt ausgelagert. Die Ableitung des Abwassers auf öffentlichem Grund sowie die Abwasserreinigung ist eine klassische öffentliche Aufgabe der Gemeinde.